花蓮縣家庭教育中心的發展歷程可追溯至民國76年10月,當時以「花蓮縣親職教育諮詢中心」為名成立,專注於推動親職教育相關服務。隨著家庭教育業務範疇的擴大,於民國79年更名為「花蓮縣家庭教育服務中心」,以提供更多元化的家庭教育資源。
到了民國88年,本中心再度更名為「花蓮縣家庭教育中心」,並隸屬於花蓮縣文化局。依家庭教育法於民國93年1月1日起,本中心的歸屬調整至花蓮縣政府教育處,進一步強化其教育推廣功能。民國94年9月1日,完成了家庭教育組織規程與編制的制定,為本中心的運作提供了更明確的方向與規範。
自民國95年度起,花蓮縣家庭教育中心成為隸屬縣政府的二級單位,同時接受縣政府教育處的指揮與監督。至民國104年,本中心正式升格為花蓮縣政府的二級機關,繼續在縣政府教育處的監督下,致力於推動家庭教育的各項業務。透過不斷的調整與升級,花蓮縣家庭教育中心逐步成為協助縣內家庭提升教育品質的重要平台,為推廣健全的家庭價值與教育理念作出了卓越的貢獻。